要預防腸病毒，大人自外返家，接觸小朋友前，務必請先更衣、洗手、洗臉。若家中有小朋友感染腸病毒，最好避免與其他小朋友接觸，以免造成家中所有成員交互感染。
進入腸病毒高峰期時，截至2000年5月15日止通報腸病毒重症疑似病例為62例，確定病例為9例，並造成1例死亡，行政院衛生署疾病管制局特別呼籲民眾，在腸病毒流行期期間務必提高警覺，時時注意個人衛生，以降低感染的危險性，而年齡在三歲以下的嬰幼兒常為腸病毒感染併發重症之高危險群，父母、褓母、或經常接觸幼兒者，更應加強預防措施，避免將病毒傳染給幼兒。疾病管制局提供幾個方法供家長參考：
在生活中預防腸病毒
1. 增強個人之免疫力：注意營養、均衡飲食及運動。
2. 加強個人衛生：尤其需勤於正確洗手，以防止感染或藉由接觸將病毒傳染給嬰幼兒。
3. 注意環境衛生：保持環境清潔及通風良好。
4. 注意玩具是否乾淨：絨毛玩具最易藏污納垢，常是傳染病源的媒介。
5. 避免接觸受感染者：避免出入過度擁擠之公共場所、不要與疑似病患(家人或同學)接觸，流行期間，十二歲以下之小朋友，更應減少出入公共場所。
6. 高危險群：三歲以下小孩要特別小心，有較高比率得到腦炎、類小兒麻痺症候群或肺水腫。
7. 如有疑似症狀請儘速就醫。
學校、幼稚園、托兒所預防腸病毒方法
1. 提供充足且適當之洗手設備，包括潔淨之廁所、安全之自來水設施、以及肥皂等洗潔劑之提供。
2. 注意環境衛生，保持活動場所之清潔與通風。
3. 共用之玩具、遊樂設施(如電動馬、溜滑梯、鞦韆等)要經常保持清潔。
4. 活動場所應避免人潮過度擁擠，以防接觸感染。
5. 提供充足且必要的清潔工具與清潔劑，例如：清洗廁所等所帶之防水手套、消毒劑等，避免學童或工作人員未採行適當防護而接觸感染原。
6. 時時注意幼（學）童之健康與請假情況，如有必要，應與教育單位、社政單位、衛生單位等研商決定幼（學）童請假或停止上課事宜。
最重要的是大人自外返家，接觸小朋友前，務必請先更衣、洗手、洗臉。若家中有小朋友感染腸病毒，最好避免與其他小朋友接觸，以免造成家中所有成員交互感染。
